「桜の花びらの落ちるスピードだよ。秒速5センチメートル」明里と貴樹。小学校で出会った2人は中学で離れ離れになり、それぞれの恋心と魂はさまよい続ける。

サクラハナ・ビラ先生は桜専門の精神科医。ストレスで病気になった桜の治療をしています。
時代も国も違う3つの桜の物語。

今年も枝いっぱいに咲いた桜の花びらで、しょうきちじいさんはさくらまんじゅうを作ります。
このさくらまんじゅうに込められた想いとは…。